Отдел занимается вопросами, связанными с различными магическими существами. Например, в шестой книге Корнелиус Фадж упоминает о том, что именно этот Отдел контролирует перевозку драконов и сфинкса для Турнира Трёх Волшебников.
Печать Отдела регулирования магических популяций и контроля над ними

В состав Отдела входят Управление по связям с гоблинами и кентаврами. Однако кентавры, предпочитая не иметь с волшебниками никаких дел, ни разу не связывались с этим Управлением с момента его основания. Поэтому в Министерстве фраза «быть переведённым в Управление по связям с кентаврами» означает, что волшебника собираются уволить.

Именно с этого Отдела начала свою карьеру Гермиона Грейнджер перед тем, как перейти в Отдел обеспечения магического правопорядка.

Отдел включает в себя следующие подразделения:

* Подразделение зверей
* Подразделение существ
* Подразделение духов
* Управление по связям с гоблинами — Катберт Мокридж — начальник подразделения.
* Консультационное бюро по борьбе с вредителями
* Управление по связям с кентаврами
* Бюро регистрации и контроля вервольфов
* Бюро по розыску и контролю драконов
* Бюро распределения домовых эльфов
* Комитет по избавлению от опасных существ — бывший глава подразделения и палач — Уолден Макнейр, один из Пожирателей смерти.